photoproductionAkbar, Z.; Roy, P.; Park, S.; Crede, V.; Anisovich, A. V.; Denisenko, I.; Klempt, E.; Nikonov, V. A.; Sarantsev, A. V.; Adhikari, K. P.; Adhikari, S.; Amaryan, M. J.; Anefalos Pereira, S.; Avakian, H.; Ball, J.; Battaglieri, M.; Batourine, V.; Bedlinskiy, I.; Boiarinov, S.; Briscoe, W. J.; Brock, J.; Brooks, W. K.; Burkert, V. D.; Cao, F. T.; Carlin, C.; Carman, D. S.; Celentano, A.; Charles, G.; Chetry, T.; Ciullo, G.; Clark, L.; Cole, P. L.; Contalbrigo, M.; Cortes, O.; D'Angelo, A.; Dashyan, N.; De Vita, R.; De Sanctis, E.; Deur, A.; Djalali, C.; Dugger, M.; Dupre, R.; Egiyan, H.; El Fassi, L.; Eugenio, P.; Fedotov, G.; Fersch, R.; Filippi, A.; Fradi, A.; Garçon, M.; Gevorgyan, N.; Giovanetti, K. L.; Girod, F. X.; Gleason, C.; Gohn, W.; Golovatch, E.; Gothe, R. W.; Griffioen, K. A.; Guidal, M.; Guo, L.; Hafidi, K.; Hakobyan, H.; Hanretty, C.; Harrison, N.; Hattawy, M.; Heddle, D.; Hicks, K.; Hollis, G.; Holtrop, M.; Ireland, D. G.; Ishkhanov, B. S.; Isupov, E. L.; Jenkins, D.; Joosten, S.; Keith, C. D.; Keller, D.; Khachatryan, G.; Khachatryan, M.; Khandaker, M.; Kim, A.; Kim, W.; Klein, A.; Klein, F. J.; Kubarovsky, V.; Lanza, L.; Livingston, K.; MacGregor, I. J. D.; Markov, N.; McKinnon, B.; Meekins, D. G.; Mineeva, T.; Mokeev, V.; Movsisyan, A.; Munoz Camacho, C.; Nadel-Turonski, P.; Niccolai, S.; Osipenko, M.; Ostrovidov, A. I.; Paolone, M.; Paremuzyan, R.; Park, K.; Pasyuk, E.; Phelps, W.; Pogorelko, O.; Price, J. W.; Prok, Y.; Protopopescu, D.; Raue, B. A.; Ripani, M.; Ritchie, B. G.; Rizzo, A.; Rosner, G.; Sabatié, F.; Salgado, C.; Schumacher, R. A.; Sharabian, Y. G.; Skorodumina, Iu.; Smith, G. D.; Sober, D. I.; Sokhan, D.; Sparveris, N.; Stepanyan, S.; Strakovsky, I. I.; Strauch, S.; Taiuti, M.; Ungaro, M.; Voskanyan, H.; Voutier, E.; Wei, X.; Wood, M. H.; Zachariou, N.; Zana, L.; Zhang, J.; Zhao, Z. W. · Physical Review C · 2017

hyperons using the CLAS detector at Jefferson LaboratoryMcCracken, M. E.; Bellis, M.; Adhikari, K. P.; Adikaram, D.; Akbar, Z.; Pereira, S. Anefalos; Badui, R. A.; Ball, J.; Baltzell, N. A.; Battaglieri, M.; Batourine, V.; Bedlinskiy, I.; Biselli, A. S.; Boiarinov, S.; Briscoe, W. J.; Brooks, W. K.; Burkert, V. D.; Cao, T.; Carman, D. S.; Celentano, A.; Chandavar, S.; Charles, G.; Colaneri, L.; Cole, P. L.; Contalbrigo, M.; Cortes, O.; Crede, V.; D’Angelo, A.; Dashyan, N.; De Vita, R.; De Sanctis, E.; Deur, A.; Djalali, C.; Dodge, G. E.; Dupre, R.; Alaoui, A. El; Fassi, L. El; Elouadrhiri, E.; Eugenio, P.; Fedotov, G.; Fegan, S.; Fersch, R.; Filippi, A.; Fleming, J. A.; Garillon, B.; Gevorgyan, N.; Gilfoyle, G. P.; Giovanetti, K. L.; Girod, F. X.; Golovatch, E.; Gothe, R. W.; Griffioen, K. A.; Guidal, M.; Guo, L.; Hafidi, K.; Hakobyan, H.; Hanretty, C.; Hattawy, M.; Hicks, K.; Holtrop, M.; Hughes, S. M.; Ilieva, Y.; Ireland, D. G.; Ishkhanov, B. S.; Isupov, E. L.; Jenkins, D.; Jiang, H.; Jo, H. S.; Keller, D.; Khachatryan, G.; Khandaker, M.; Kim, A.; Kim, W.; Klein, A.; Klein, F. J.; Kubarovsky, V.; Lenisa, P.; Livingston, K.; Lu, H. Y.; MacGregor, I. J. D.; Mayer, M.; McKinnon, B.; Mestayer, M. D.; Meyer, C. A.; Mirazita, M.; Mokeev, V.; Moody, C. I.; Moriya, K.; Camacho, C. Munoz; Nadel-Turonski, P.; Net, L. A.; Niccolai, S.; Osipenko, M.; Ostrovidov, A. I.; Park, K.; Pasyuk, E.; Pisano, S.; Pogorelko, O.; Price, J. W.; Procureur, S.; Prok, Y.; Raue, B. A.; Ripani, M.; Rizzo, A.; Rosner, G.; Roy, P.; Sabatié, F.; Salgado, C.; Schumacher, R. A.; Seder, E.; Sharabian, Y. G.; Skorodumina, Iu.; Sokhan, D.; Sparveris, N.; Stoler, P.; Strakovsky, I. I.; Strauch, S.; Sytnik, V.; Tian, Ye; Ungaro, M.; Voskanyan, H.; Voutier, E.; Walford, N. K.; Watts, D. P.; Wei, X.; Wood, M. H.; Zachariou, N.; Zana, L.; Zhang, J.; Zhao, Z. W.; Zonta, I. · Physical Review D · 2015

mesonDickson, R.; Schumacher, R. A.; Adhikari, K. P.; Akbar, Z.; Amaryan, M. J.; Anefalos Pereira, S.; Badui, R. A.; Ball, J.; Battaglieri, M.; Batourine, V.; Bedlinskiy, I.; Biselli, A.; Boiarinov, S.; Briscoe, W. J.; Burkert, V. D.; Cao, T.; Carman, D. S.; Celentano, A.; Chandavar, S.; Charles, G.; Chetry, T.; Ciullo, G.; Colaneri, L.; Cole, P. L.; Compton, N.; Contalbrigo, M.; Cortes, O.; Crede, V.; D'Angelo, A.; Dashyan, N.; De Vita, R.; De Sanctis, E.; Deur, A.; Djalali, C.; Dugger, M.; Dupre, R.; El Alaoui, A.; El Fassi, L.; Eugenio, P.; Fanchini, E.; Fedotov, G.; Filippi, A.; Fleming, J. A.; Gevorgyan, N.; Ghandilyan, Y.; Gilfoyle, G. P.; Giovanetti, K. L.; Girod, F. X.; Gothe, R. W.; Griffioen, K. A.; Guo, L.; Hafidi, K.; Hakobyan, H.; Hanretty, C.; Harrison, N.; Hattawy, M.; Holtrop, M.; Hicks, K.; Hughes, S. M.; Ilieva, Y.; Ireland, D. G.; Ishkhanov, B. S.; Isupov, E. L.; Jiang, H.; Jo, H. S.; Joosten, S.; Keller, D.; Khachatryan, G.; Khandaker, M.; Kim, A.; Kim, W.; Klein, F. J.; Kubarovsky, V.; Kuleshov, S. V.; Lanza, L.; Lenisa, P.; Livingston, K.; Lu, H. Y.; MacGregor, I. J. D.; Mattione, P.; McKinnon, B.; Meyer, C. A.; Mirazita, M.; Markov, N.; Mokeev, V.; Moriya, K.; Munevar, E.; Murdoch, G.; Nadel-Turonski, P.; Net, L. A.; Ni, A.; Osipenko, M.; Ostrovidov, A. I.; Park, K.; Pasyuk, E.; Phelps, W.; Pisano, S.; Pogorelko, O.; Price, J. W.; Prok, Y.; Puckett, A. J. R.; Raue, B. A.; Ripani, M.; Rizzo, A.; Rosner, G.; Roy, P.; Salgado, C.; Seder, E.; Sharabian, Y. G.; Skorodumina, Iu.; Smith, E. S.; Smith, G. D.; Sober, D.; Sokhan, D.; Sparveris, N.; Stepanyan, S.; Strakovsky, I. I.; Stankovic, I.; Strauch, S.; Sytnik, V.; Taiuti, M.; Ungaro, M.; Voskanyan, H.; Voutier, E.; Walford, N. K.; Watts, D. P.; Weygand, D.; Wood, M. H.; Zachariou, N.; Zana, L.; Zhang, J.; Zonta, I. · Physical Review C · 2016

meson pairs on the protonLombardo, S.; Battaglieri, M.; Celentano, A.; D’Angelo, A.; De Vita, R.; Filippi, A.; Glazier, D. I.; Hughes, S. M.; Mathieu, V.; Rizzo, A.; Santopinto, E.; Stankovic, I.; Szczepaniak, A. P.; Watts, D.; Zana, L.; Adhikari, S.; Akbar, Z.; Avakian, H.; Ball, J.; Baltzell, N. A.; Barion, L.; Bashkanov, M.; Batourine, V.; Bedlinskiy, I.; Biselli, A. S.; Boiarinov, S.; Briscoe, W. J.; Burkert, V. D.; Cao, F.; Carman, D. S.; Chatagnon, P.; Chetry, T.; Ciullo, G.; Clark, L.; Clary, B. A.; Cole, P. L.; Contalbrigo, M.; Crede, V.; Dashyan, N.; De Sanctis, E.; Defurne, M.; Deur, A.; Diehl, S.; Djalali, C.; Dugger, M.; Dupre, R.; Egiyan, H.; Ehrhart, M.; El Alaoui, A.; El Fassi, L.; Eugenio, P.; Fedotov, G.; Gavalian, G.; Ghandilyan, Y.; Gilfoyle, G. P.; Giovanetti, K. L.; Girod, F. X.; Golovatch, E.; Gothe, R. W.; Griffioen, K. A.; Guidal, M.; Guo, L.; Hafidi, K.; Hakobyan, H.; Harrison, N.; Hattawy, M.; Heddle, D.; Hicks, K.; Holtrop, M.; Ilieva, Y.; Ireland, D. G.; Ishkhanov, B. S.; Isupov, E. L.; Jenkins, D.; Jo, H. S.; Johnston, S.; Joo, K.; Kabir, M. L.; Keller, D.; Khachatryan, G.; Khachatryan, M.; Khandaker, M.; Kim, A.; Kim, W.; Klein, A.; Klein, F. J.; Kubarovsky, V.; Lanza, L.; Lenisa, P.; Livingston, K.; MacGregor, I. J. D.; Marchand, D.; Markov, N.; McKinnon, B.; Mestayer, M. D.; Meyer, C. A.; Meziani, Z. E.; Mirazita, M.; Mokeev, V.; Montgomery, R. A.; Munoz Camacho, C.; Nadel-Turonski, P.; Niccolai, S.; Niculescu, G.; Osipenko, M.; Ostrovidov, A. I.; Paolone, M.; Paremuzyan, R.; Park, K.; Pasyuk, E.; Pogorelko, O.; Price, J. W.; Prok, Y.; Protopopescu, D.; Ripani, M.; Riser, D.; Ritchie, B. G.; Rosner, G.; Sabatié, F.; Salgado, C.; Schumacher, R. A.; Sharabian, Y. G.; Skorodumina, Iu.; Smith, G. D.; Sober, D. I.; Sokhan, D.; Sparveris, N.; Strakovsky, I. I.; Strauch, S.; Taiuti, M.; Tan, J. A.; Ungaro, M.; Voskanyan, H.; Voutier, E.; Wang, R.; Wei, X.; Wood, M. H.; Zachariou, N.; Zhang, J.; Zhao, Z. W. · Physical Review D · 2018

Beam-target double-spin asymmetry in quasielastic electron scattering off the deuteron with CLASMayer, M.; Kuhn, S. E.; Adhikari, K. P.; Akbar, Z.; Anefalos Pereira, S.; Asryan, G.; Avakian, H.; Badui, R. A.; Ball, J.; Baltzell, N. A.; Battaglieri, M.; Bedlinskiy, I.; Biselli, A. S.; Boiarinov, S.; Bosted, P.; Briscoe, W. J.; Brooks, W. K.; Bültmann, S.; Burkert, V. D.; Carman, D. S.; Celentano, A.; Charles, G.; Chetry, T.; Ciullo, G.; Clark, L.; Colaneri, L.; Cole, P. L.; Compton, N.; Contalbrigo, M.; Crede, V.; D'Angelo, A.; Dashyan, N.; De Vita, R.; De Sanctis, E.; Deur, A.; Djalali, C.; Dupre, R.; El Alaoui, A.; El Fassi, L.; Elouadrhiri, L.; Eugenio, P.; Fanchini, E.; Fedotov, G.; Fersch, R.; Filippi, A.; Fleming, J. A.; Forest, T. A.; Ghandilyan, Y.; Gilfoyle, G. P.; Giovanetti, K. L.; Girod, F. X.; Gleason, C.; Gothe, R. W.; Griffioen, K. A.; Guidal, M.; Guler, N.; Guo, L.; Hakobyan, H.; Hanretty, C.; Hattawy, M.; Hicks, K.; Holtrop, M.; Hughes, S. M.; Hyde, C. E.; Ilieva, Y.; Ireland, D. G.; Ishkhanov, B. S.; Isupov, E. L.; Jiang, H.; Keith, C.; Keller, D.; Khachatryan, G.; Khachatryan, M.; Khandaker, M.; Kim, A.; Kim, W.; Klein, A.; Kubarovsky, V.; Lanza, L.; Lenisa, P.; Livingston, K.; MacGregor, I. J. D.; McKinnon, B.; Meekins, D.; Mirazita, M.; Mokeev, V.; Movsisyan, A.; Net, L. A.; Niccolai, S.; Niculescu, G.; Osipenko, M.; Ostrovidov, A. I.; Paremuzyan, R.; Park, K.; Pasyuk, E.; Phelps, W.; Pogorelko, O.; Price, J. W.; Prok, Y.; Puckett, A. J. R.; Ripani, M.; Rizzo, A.; Rosner, G.; Rossi, P.; Sabatié, F.; Schumacher, R. A.; Sharabian, Y. G.; Skorodumina, Iu.; Smith, G. D.; Sokhan, D.; Sparveris, N.; Stankovic, I.; Stepanyan, S.; Strauch, S.; Sytnik, V.; Taiuti, M.; Tian, Ye; Torayev, B.; Ungaro, M.; Voskanyan, H.; Voutier, E.; Walford, N. K.; Weinstein, L. B.; Wood, M. H.; Zachariou, N.; Zhang, J.; Zonta, I. · Physical Review C · 2017

Resonance RegionHo, D.; Peng, P.; Bass, C.; Collins, P.; D’Angelo, A.; Deur, A.; Fleming, J.; Hanretty, C.; Kageya, T.; Khandaker, M.; Klein, F. J.; Klempt, E.; Laine, V.; Lowry, M. M.; Lu, H.; Nepali, C.; Nikonov, V. A.; O’Connell, T.; Sandorfi, A. M.; Sarantsev, A. V.; Schumacher, R. A.; Strakovsky, I. I.; Švarc, A.; Walford, N. K.; Wei, X.; Whisnant, C. S.; Workman, R. L.; Zonta, I.; Adhikari, K. P.; Adikaram, D.; Akbar, Z.; Amaryan, M. J.; Anefalos Pereira, S.; Avakian, H.; Ball, J.; Bashkanov, M.; Battaglieri, M.; Batourine, V.; Bedlinskiy, I.; Biselli, A.; Briscoe, W. J.; Burkert, V. D.; Carman, D. S.; Celentano, A.; Charles, G.; Chetry, T.; Ciullo, G.; Clark, L.; Colaneri, L.; Cole, P. L.; Contalbrigo, M.; Crede, V.; Dashyan, N.; De Sanctis, E.; De Vita, R.; Djalali, C.; Dupre, R.; El Alaoui, A.; El Fassi, L.; Elouadrhiri, L.; Eugenio, P.; Fedotov, G.; Fegan, S.; Fersch, R.; Filippi, A.; Fradi, A.; Ghandilyan, Y.; Gilfoyle, G. P.; Girod, F. X.; Glazier, D. I.; Gleason, C.; Gohn, W.; Golovatch, E.; Gothe, R. W.; Griffioen, K. A.; Guidal, M.; Guo, L.; Hakobyan, H.; Harrison, N.; Hattawy, M.; Hicks, K.; Holtrop, M.; Hughes, S. M.; Ilieva, Y.; Ireland, D. G.; Ishkhanov, B. S.; Isupov, E. L.; Jenkins, D.; Jiang, H.; Jo, H. S.; Joo, K.; Joosten, S.; Keller, D.; Khachatryan, G.; Kim, A.; Kim, W.; Klein, A.; Kubarovsky, V.; Kuleshov, S. V.; Lanza, L.; Lenisa, P.; Livingston, K.; MacGregor, I. J. D.; Markov, N.; McKinnon, B.; Mineeva, T.; Mokeev, V.; Montgomery, R. A.; Movsisyan, A.; Munoz Camacho, C.; Murdoch, G.; Niccolai, S.; Niculescu, G.; Osipenko, M.; Paolone, M.; Paremuzyan, R.; Park, K.; Pasyuk, E.; Phelps, W.; Pogorelko, O.; Price, J. W.; Procureur, S.; Protopopescu, D.; Ripani, M.; Riser, D.; Ritchie, B. G.; Rizzo, A.; Rosner, G.; Sabatié, F.; Salgado, C.; Sharabian, Y. G.; Skorodumina, Iu.; Smith, G. D.; Sober, D. I.; Sokhan, D.; Sparveris, N.; Strauch, S.; Tian, Ye; Torayev, B.; Ungaro, M.; Voskanyan, H.; Voutier, E.; Watts, D. P.; Wood, M. H.; Zachariou, N.; Zhang, J.; · Physical Review Letters · 2017

andWilliams, M.; Krahn, Z.; Applegate, D.; Bellis, M.; Meyer, C. A.; Adhikari, K. P.; Anghinolfi, M.; Baghdasaryan, H.; Ball, J.; Battaglieri, M.; Bedlinskiy, I.; Berman, B. L.; Biselli, A. S.; Bookwalter, C.; Briscoe, W. J.; Brooks, W. K.; Burkert, V. D.; Careccia, S. L.; Carman, D. S.; Cole, P. L.; Collins, P.; Crede, V.; D’Angelo, A.; Daniel, A.; Vita, R. De; Sanctis, E. De; Deur, A.; Dey, B.; Dhamija, S.; Dickson, R.; Djalali, C.; Dodge, G. E.; Doughty, D.; Dugger, M.; Dupre, R.; Alaoui, A. El; Elouadrhiri, L.; Eugenio, P.; Fegan, S.; Fradi, A.; Gabrielyan, M. Y.; Garçon, M.; Gilfoyle, G. P.; Giovanetti, K. L.; Girod, F. X.; Gohn, W.; Golovatch, E.; Gothe, R. W.; Griffioen, K. A.; Guidal, M.; Guler, N.; Guo, L.; Hafidi, K.; Hakobyan, H.; Hanretty, C.; Hassall, N.; Hicks, K.; Holtrop, M.; Ilieva, Y.; Ireland, D. G.; Ishkhanov, B. S.; Isupov, E. L.; Jawalkar, S. S.; Jo, H. S.; Johnstone, J. R.; Joo, K.; Keller, D.; Khandaker, M.; Khetarpal, P.; Kim, W.; Klein, A.; Klein, F. J.; Kubarovsky, V.; Kuleshov, S. V.; Kuznetsov, V.; Livingston, K.; Lu, H. Y.; Mayer, M.; McAndrew, J.; McCracken, M. E.; McKinnon, B.; Mikhailov, K.; Mineeva, T.; Mirazita, M.; Mokeev, V.; Moriya, K.; Morrison, B.; Munevar, E.; Nadel-Turonski, P.; Nepali, C. S.; Niccolai, S.; Niculescu, G.; Niculescu, I.; Niroula, M. R.; Niyazov, R. A.; Osipenko, M.; Ostrovidov, A. I.; Park, K.; Park, S.; Pasyuk, E.; Pereira, S. Anefalos; Perrin, Y.; Pieschacon, D.; Pisano, S.; Pogorelko, O.; Pozdniakov, S.; Price, J. W.; Procureur, S.; Prok, Y.; Protopopescu, D.; Raue, B. A.; Ricco, G.; Ripani, M.; Ritchie, B. G.; Rosner, G.; Rossi, P.; Sabatié, F.; Saini, M. S.; Salamanca, J.; Salgado, C.; Schott, D.; Schumacher, R. A.; Seraydaryan, H.; Sharabian, Y. G.; Smith, E. S.; Sober, D. I.; Sokhan, D.; Stepanyan, S. S.; Stoler, P.; Strakovsky, I. I.; Strauch, S.; Taiuti, M.; Tedeschi, D. J.; Tkachenko, S.; Ungaro, M.; Vineyard, M. F.; Voutier, E.; Watts, D. P.; Weinstein, L. B.; Weygand, D. P.; Wood, M. H.; Zhang, J.; · Physical Review C · 2009

Quantifying uniformity of mapped readsHower, V.; Starfield, R.; Roberts, A.; Pachter, L. · Bioinformatics · 2012

Guest Editors' IntroductionChen, Jianer; Măndoiu, Ion; Sunderraman, Raj; Wang, Jianxin; Zelikovsky, Alexander · BMC Bioinformatics · 2012

Computing the protein binding sitesGuo, Fei; Wang, Lusheng · BMC Bioinformatics · 2012

Biological event compositionKilicoglu, Halil; Bergler, Sabine · BMC Bioinformatics · 2012

Robust design of microbial strainsCostanza, J.; Carapezza, G.; Angione, C.; Lio, P.; Nicosia, G. · Bioinformatics · 2012

Identification of distant family relationshipsSkare, O.; Sheehan, N.; Egeland, T. · Bioinformatics · 2009

A microcomputer network for biochemistryPeterson, Julian A. · Bioinformatics · 1985

Advanced Complex Trait AnalysisGray, A.; Stewart, I.; Tenesa, A. · Bioinformatics · 2012