海量图书期刊资源,随时随地畅享阅读乐趣
Reliable prediction of regulator targets using 12 Drosophila genomesKheradpour, P.; Stark, A.; Roy, S.; Kellis, M. · Genome Research · 2007
Systematic discovery and characterization of fly microRNAs using 12 Drosophila genomesStark, A.; Kheradpour, P.; Parts, L.; Brennecke, J.; Hodges, E.; Hannon, G. J.; Kellis, M. · Genome Research · 2007
A single Hox locus in Drosophila produces functional microRNAs from opposite DNA strandsStark, A.; Bushati, N.; Jan, C. H.; Kheradpour, P.; Hodges, E.; Brennecke, J.; Bartel, D. P.; Cohen, S. M.; Kellis, M. · Genes & Development · 2008
Locating protein-coding sequences under selection for additional, overlapping functions in 29 mammalian genomesLin, M. F.; Kheradpour, P.; Washietl, S.; Parker, B. J.; Pedersen, J. S.; Kellis, M. · Genome Research · 2011
Systematic dissection of regulatory motifs in 2000 predicted human enhancers using a massively parallel reporter assayKheradpour, P.; Ernst, J.; Melnikov, A.; Rogov, P.; Wang, L.; Zhang, X.; Alston, J.; Mikkelsen, T. S.; Kellis, M. · Genome Research · 2013
ChIP-seq guidelines and practices of the ENCODE and modENCODE consortiaLandt, S. G.; Marinov, G. K.; Kundaje, A.; Kheradpour, P.; Pauli, F.; Batzoglou, S.; Bernstein, B. E.; Bickel, P.; Brown, J. B.; Cayting, P.; Chen, Y.; DeSalvo, G.; Epstein, C.; Fisher-Aylor, K. I.; Euskirchen, G.; Gerstein, M.; Gertz, J.; Hartemink, A. J.; Hoffman, M. M.; Iyer, V. R.; Jung, Y. L.; Karmakar, S.; Kellis, M.; Kharchenko, P. V.; Li, Q.; Liu, T.; Liu, X. S.; Ma, L.; Milosavljevic, A.; Myers, R. M.; Park, P. J.; Pazin, M. J.; Perry, M. D.; Raha, D.; Reddy, T. E.; Rozowsky, J.; Shoresh, N.; Sidow, A.; Slattery, M.; Stamatoyannopoulos, J. A.; Tolstorukov, M. Y.; White, K. P.; Xi, S.; Farnham, P. J.; Lieb, J. D.; Wold, B. J.; Snyder, M. · Genome Research · 2012
The Genotype-Tissue Expression (GTEx) pilot analysis: Multitissue gene regulation in humansArdlie, K. G.; Deluca, D. S.; Segre, A. V.; Sullivan, T. J.; Young, T. R.; Gelfand, E. T.; Trowbridge, C. A.; Maller, J. B.; Tukiainen, T.; Lek, M.; Ward, L. D.; Kheradpour, P.; Iriarte, B.; Meng, Y.; Palmer, C. D.; Esko, T.; Winckler, W.; Hirschhorn, J. N.; Kellis, M.; MacArthur, D. G.; Getz, G.; Shabalin, A. A.; Li, G.; Zhou, Y.-H.; Nobel, A. B.; Rusyn, I.; Wright, F. A.; Lappalainen, T.; Ferreira, P. G.; Ongen, H.; Rivas, M. A.; Battle, A.; Mostafavi, S.; Monlong, J.; Sammeth, M.; Mele, M.; Reverter, F.; Goldmann, J. M.; Koller, D.; Guigo, R.; McCarthy, M. I.; Dermitzakis, E. T.; Gamazon, E. R.; Im, H. K.; Konkashbaev, A.; Nicolae, D. L.; Cox, N. J.; Flutre, T.; Wen, X.; Stephens, M.; Pritchard, J. K.; Tu, Z.; Zhang, B.; Huang, T.; Long, Q.; Lin, L.; Yang, J.; Zhu, J.; Liu, J.; Brown, A.; Mestichelli, B.; Tidwell, D.; Lo, E.; Salvatore, M.; Shad, S.; Thomas, J. A.; Lonsdale, J. T.; Moser, M. T.; Gillard, B. M.; Karasik, E.; Ramsey, K.; Choi, C.; Foster, B. A.; Syron, J.; Fleming, J.; Magazine, H.; Hasz, R.; Walters, G. D.; Bridge, J. P.; Miklos, M.; Sullivan, S.; Barker, L. K.; Traino, H. M.; Mosavel, M.; Siminoff, L. A.; Valley, D. R.; Rohrer, D. C.; Jewell, S. D.; Branton, P. A.; Sobin, L. H.; Barcus, M.; Qi, L.; McLean, J.; Hariharan, P.; Um, K. S.; Wu, S.; Tabor, D.; Shive, C.; Smith, A. M.; Buia, S. A.; Undale, A. H.; Robinson, K. L.; Roche, N.; Valentino, K. M.; Britton, A.; Burges, R.; Bradbury, D.; Hambright, K. W.; Seleski, J.; Korzeniewski, G. E.; Erickson, K.; Marcus, Y.; Tejada, J.; Taherian, M.; Lu, C.; Basile, M.; Mash, D. C.; Volpi, S.; Struewing, J. P.; Temple, G. F.; Boyer, J.; Colantuoni, D.; Little, R.; Koester, S.; Carithers, L. J.; Moore, H. M.; Guan, P.; Compton, C.; Sawyer, S. J.; Demchok, J. P.; Vaught, J. B.; Rabiner, C. A.; Lockhart, N. C.; Ardlie, K. G.; Getz, G.; Wright, F. A.; Kellis, M.; Volpi, S.; Dermitzakis, E. T. · Science · 2015
Characterization of extracellular circulating microRNATurchinovich, A.; Weiz, L.; Langheinz, A.; Burwinkel, B. · Nucleic Acids Research · 2011
The Pfam protein families databaseBateman, A. · Nucleic Acids Research · 2004
PIC: Protein Interactions CalculatorTina, K. G.; Bhadra, R.; Srinivasan, N. · Nucleic Acids Research · 2007
Vienna RNA secondary structure serverHofacker, I. L. · Nucleic Acids Research · 2003
Sequence conservation in Alu evolutionLabuda, Damian; Striker, George · Nucleic Acids Research · 1989
Real-time PCR in virologyMackay, I. M. · Nucleic Acids Research · 2002
Parallel stranded duplex DNARamsing, Niles B.; Jovin, Thomas M. · Nucleic Acids Research · 1988
APID: Agile Protein Interaction DataAnalyzerPrieto, C.; De Las Rivas, J. · Nucleic Acids Research · 2006